Segawa Kotarou aime les bonsaïs plus que tout. Il adore lire sur les mousses et les plantes, à tel point que son entourage lui dit qu’il a l’air d’un grand-père. Pour payer ses frais d’inscription à l’université, Kotarou est professeur de bachotage pendant les vacances d’été. Il y rencontre Nakatsu Towa, qui travaille dans un atelier de réparation d’ordinateurs situé en dessous de l’école. Lorsque Kotarou découvre que Towa élève également des bonsaïs, il lui demande de devenir son ami. Mais s’agira-t-il d’une simple amitié ou en résultera-t-il quelque chose de plus ?